Mario Inostroza-Ponta

Director del Programa de Magíster en Ingeniería Informática

Reseña

Mario Inostroza Ponta obtiene su maestría el año 2000 en la Universidad de Santiago de Chile y su PhD el año 2008 en la Universidad de Newcastle en Australia. Es miembro del Departamento de Ingeniería Informática de la Universidad de Santiago de Chile desde el año 2002. Además, tiene experiencia de trabajo en la industria en desarrollo e integración de plataformas de aprovisionamiento. Su principal experiencia es en ingeniería en computación o ciencias de la computación, específicamente en las áreas de heurísticas y metaheurísticas, aplicadas a problemas de optimización combinatoria en programación y bioinformática, entre otros.

Grados
Año Grado/Título Institución
2008 PhD Computer Science The University of Newcastle
2000 Magíster en Ingeniería Informática Universidad de Santiago de Chile
1999 Ingeniero Civil en Informática Universidad de Santiago de Chile
1998 Licenciado en Ciencias de la Ingeniería Universidad de Santiago de Chile

Publicaciones en revistas indexadas

  1. Ramírez-Castrillón, Mauricio; Mendes, Sandra Denise Camargo; Inostroza-Ponta, Mario; Valente, Patricia. (GTG)5 MSP-PCR Fingerprinting as a Technique for Discrimination of Wine Associated Yeasts?. Plos One, v. 9, p. e105870, 2014.
  2. Clark, M. B., Johnston, R. L., Inostroza-Ponta, M., Fox, A. H., Fortini, E., Moscato, P., Dinger, M. E., and Mattick, J. S. (2012). Genome-wide analysis of long noncoding RNA stability. Genome Research. Published in Advance March 9, 2012, doi: 10.1101/gr.131037.111
  3. Ahmed Shamsul Arefin ; Inostroza-Ponta, Mario; Luke Mathieson; Regina, B. ; Moscato, Pablo  (2011) Clustering Nodes in Large-Scale Biological Networks Using External Memory Algorithms. Lecture Notes in Computer Science, v. 7017, p. 375-386.
  4. Inostroza-Ponta M, Berretta R, Moscato P (2011) QAPgrid: A Two Level QAP-Based Approach forLarge-ScaleData Analysis and Visualization. PLoS ONE 6(1): e14468.doi:10.1371/journal.pone.0014468.
  5. C Riveros, D Mellor, KS Gandhi, FC McKay, MB Cox, R Berretta, SY Vaezpour, M Inostroza-Ponta, SA Broadley, RN Heard, S Vucic, GJ Stewart, DW Williams, RJ Scott, J Lechner-Scott,DR Booth, P Moscato. (2010) A Transcription Factor Map as Revealed by a Genome-Wide Gene Expression Analysis of Whole-Blood mRNA Transcriptome in Multiple Sclerosis. PLoS ONE 5(12):e14176. doi:10.1371/journal.pone.0014176.
  6. Capp A, Inostroza-Ponta M, Bill D, Moscato P, Lai C, Christie D, Lamb D, Turner S, Joseph D,Matthews J, Atkinson C, North J, Poulsen M, Spry NA, Tai KH, Wynne C, Duchesne G, Steigler A,Denham JW. (2009) Is there more than one proctitis syndrome? A revisitation using data from the TROG 96.01 trial, Radiotherapy & Oncology, Mar;90(3):400-407.
  7. M. Inostroza-Ponta, A. Mendes, R. Berretta and P. Moscato. (2007) An integrated QAP-based approach to visualize patterns of gene expression similarity. Lecture Notes in Artificial Intelligence,vol 4828, pp 156-167.
  8. M. Inostroza-Ponta, R. Berretta, A. Mendes, and P. Moscato (2006), An automatic graph layout procedure to visualize correlated data, in Artificial Intelligence in Theory and Practice ser. IFIP International Federation for Information Processing, M. Bramer, Ed., vol. 217. Springer, pp. 179-188.
  9. P. Pinacho, M. Solar, M. Inostroza and R. Muñoz (2004), Using Genetic Algorithms and Tabu Search Parallel Models to Solve the Scheduling Problem, in Artificial Intelligence Applications and Innovations. M. Bramer and V. Devedzic Ed., vol. 154. Kluwer Academic Publishers, pp. 343-358.
  10. M. Solar and M. Inostroza (2004), A Scheduling Algorithm to Optimize Real-World Applications.ICDCSW 04: Proceedings of the 24th International Conference on Distributed Computing Systems Workshops-W7: EC (ICDCSW04). IEEE Computer Society, pp. 858-862.
  11. M. Solar and M. Inostroza (2002), An Automatic Scheduler for Parallel Machines (Research Note),Euro-Par 02: Proceedings of the 8th International Euro-Par Conference on Parallel Processing. Springer-Verlag, pp. 212-216.
  12. M. Solar and M. Inostroza (2001), A parallel compiler scheduler, In Proceedings XXI International Conference of the Chilean Computer Science Society, 2001 (SCCC 2001), IEEE Computer Society, pp.256-263.

Publicaciones en congresos internacionales

  1. M. Inostroza-Ponta, R. Berretta and P. Moscato. (2010) A Memetic Algorithm for the Visualization of Relationships in Gene Expression Data Sets. ALIO-INFORMS. InternationalMeeting. Buenos Aires,Argentina. 6-9 June
  2. M. Inostroza-Ponta, R. Berretta and P. Moscato. (2010) Incorporating Memory in a Structured Population Based MA for the QAP. ALIO-INFORMS International Meeting. Buenos Aires, Argentina.6-9 June.
  3. N. Pozo-Rojas, M. Inostroza-Ponta and P. Moscato. (2010) Towards a taxonomy of centrality measures for gene expression data sets. ISCB LatinAmerican 2010. Montevideo Uruguay. 13-16 March.
  4. M. Inostroza-Ponta, A. Mendes, R. Berretta and P. Moscato. (2007) An integrated QAP-based approach to visualize patterns of gene expression similarity. ACAL 2007 – The Third Australian Conference on Artificial Life. Gold Coast, Australia. December.
  5. M. Inostroza-Ponta, R. Berretta, A. Mendes, and P. Moscato (2006), An automatic graph layout procedure to visualize correlated data, IFIP 19th World Computer Congress, Santiago, Chile. August.
  6. P. Pinacho, M. Solar,M. Inostroza and R. Muñoz (2004), Using Genetic Algorithms and Tabu SearchParallel Models to Solve the Scheduling Problem, IFIP 18th World Computer Congress. Toulouse,France. August.
  7. M. Inostroza and M. Solar (2003), Un Algoritmo de Scheduling para Multiprocesadores con Memoria Compartida, Conferencia Latinoamericana deInformática (CLEI 2003), Oct 3 -5, La Paz, Bolivia.
  8. M. Solar and M. Inostroza (2002), An Automatic Selection of Scheduling Algorithms. PAREO2002:Euro Working Group on Parallel Processing in Operations Research, Guadaloupe, Francia (Caribe),May.
  9. M. Solar and M. Inostroza (2002), The Scheduling Problem in Parallel Programming. Optimization Days 2002, Montreal, Canada, May.
  10. M. Solar and M. Inostroza (2001), A Scheduler for Parallel Shared-Memory Machine, Optimization Days 2001, Montreal, Canada, May.
  11. M. Inostroza and M. Solar (2001), Selección Automática de Algoritmos de Scheduling, Conferencia Latinoamericana de Informática (CLEI 2001), Mérida, Venezuela, Sept.
  12. M. Inostroza, B. Villalón, F. Kri, V. Parada and M. Solar (2000), A Parallel Model for the Simulated Annealing Technique, Optimization Days 2000, Montreal, Canada, May.

Publicaciones en congresos nacionales

  1. O Rojas, M Mendoza, M Marín, M Inostroza-Ponta (2010) Framework de evaluación de crawling focalizado distribuido, Workshop de Sistemas Distribuidos y Paralelismo, (WSDP-JCC 2010). Antofagasta,Chile.
  2. M. Inostroza-Ponta y P. Moscato (2008), Estudio de robustez del algoritmo de clustering basado engrafos MSTkNN, Encuentro Chileno de Computación, JCC2008. Nov 10-15. Punta Arenas, Chile.
  3. M. Inostroza, Bastías S., Villanueva M. y Ortiz C. (1999), Metaheurísticas para Coloración de Aristas de Grafos, III Congreso Chileno de Investigación Operativa OPTIMA 99, Arica. Chile.

Seminarios y otras presentaciones

  • Unsupervised techniques for the analysis of gene expression data,
    • Instituto de Informática, Universidade Federal do Rio Grande so Sul (UFGRS), 28th January 2010, Porto Alegre, Brasil.
    • Unidad de Bioinformática, Centro de Genómica Nutricional Agroacuícola (CGNA), 7th of January 2010, Temuco, Chile.
  • A Graph Approach to Visualize Correlated Data. Bioinformatics Student Symposium organized by The Bioinformatics Institute (New Zealand) and The Australian Research Council Centre in Bioinformatics (ACB), July 11 14, 2006, Auckland University, Auckland, New Zealand.
  • Discovering Shared Information from DNA Sequences and Documents: A Graph Drawing Approach.Poster Presentation, Summer Symposium in Bioinformatics: BioInfoSummer 2004, December 6 10, Australian National University, Canberra, Australia.